Course Bioinformatics

Course Description

This course discusses the basics of bioinformatics and its development as well as its relation to biochemical discussions, BLAST analysis, DNA primer and tracer design, synthetic gene construction, nucleic acids both DNA and RNA, protein analysis related to the shape and arrangement of amino acids, protein topology analysis and molecular docking. which is delivered through guided discussions and practice by carrying out computational analysis.

Program Objectives (PO)

Mampu menjelaskan konsep dasar bioinformatika, tipe data, prinsip metode, mutu data, etika, dan reproduksibilitas

Mampu menemukan, memilih, mengambil, memeriksa, dan mendokumentasikan data yang relevan
Mampu menjalankan dan menafsirkan analisis sekuens, fungsi, struktur, sifat fisikokimia, dan data omik

Aktifitas Pembelajaran

Pertemuan 1
Dasar-dasar bioinformatika,perkembangan dan perannya
Date 27 Agustus 2026
Pertemuan 2
Prinsip literasi data relevan, format data, mutu data, etika, dan reproduksibilitas analisis.
Date 17 September 2026

Pertemuan 3

Menelusuri, memilih, mengambil, dan mendokumentasikan data nukleotida, protein, struktur biomolekul, dan senyawa dari basis data publik.

Date 24 September 2026

Pertemuan 4
Melakukan pencarian kesamaan sekuens menggunakan BLAST dan mengevaluasi mutu hasilnya.
Date 1 Oktober 2026
Pertemuan 5
Melakukan penjajaran sekuens ganda serta mengidentifikasi residu atau daerah yang konservatif dan variabel.
Date 8 Oktober 2026
Pertemuan 6
Melakukan anotasi fungsi protein berdasarkan informasi domain, motif, keluarga protein, dan situs fungsional.
Date 15 Oktober 2026
Pertemuan 7
Merancang dan mengevaluasi primer secara in silico menggunakan server berbasis web.
Date 22 Oktober 2026

Pertemuan 8

Konsep dasar, penelusuran data, analisis sekuens, anotasi fungsi, dan desain primer untuk menyelesaikan kasus bioinformatika sederhana.

Date 29 Oktober 2026

Pertemuan 9
Struktur protein eksperimental dan prediktif serta menghubungkan struktur dengan fungsi biomolekul.
Date 5 November 2026
Pertemuan 10
Menganalisis sifat fisikokimia, sinyal, lokasi, dan topologi protein menggunakan perangkat berbasis web.
Date 12 November 2026
Pertemuan 11
Prinsip dasar analisis interaksi biomolekul dan analisis data omik berbasis web serta mengevaluasi keterbatasannya
Date 19 November 2026
Pertemuan 12
Merumuskan pertanyaan penelitian dan menyusun proposal mini-proyek bioinformatika berbasis web.
Date 26 November 2026
Pertemuan 13
Memperoleh, memeriksa, menyeleksi, dan mendokumentasikan data proyek serta menjalankan tahap awal analisis.
Date 3 Desember 2026
Pertemuan 14
Melaksanakan analisis utama proyek dan mengintegrasikan keluaran dari beberapa perangkat bioinformatika.
Date 10 Desember 2026
Pertemuan 15
Menyusun laporan akhir proyek yang sistematis, kritis, proporsional, dan dapat direproduksi
Date 17 Desember 2026
Pertemuan 16
Mempresentasikan, mendemonstrasikan, mempertahankan, dan mengevaluasi hasil proyek bioinformatika
Date 24 Desember 2026